Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Zcchc12-203ENSMUST00000115257 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Lrit2-201ENSMUST00000057176 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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