Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gm2035J3QP87 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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