Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top6blJ3QMY9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Top6blJ3QMY9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Top6blJ3QMY9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Top6blJ3QMY9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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