Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms