Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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