Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm5861F6VCN9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5861F6VCN9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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