Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms