Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb3D3Z6J4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms