Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2A3KGV1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms