Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c4A2ANA3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms