Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frmpd4A2AFR3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms