Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprfA2A8L5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PtprfA2A8L5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PtprfA2A8L5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PtprfA2A8L5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PtprfA2A8L5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PtprfA2A8L5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PtprfA2A8L5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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