Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Krt27Q9Z320 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms