Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vax2Q9WTP9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vax2Q9WTP9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms