Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms