Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l2Q9JLG4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms