Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nectin3Q9JLB9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nectin3Q9JLB9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nectin3Q9JLB9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nectin3Q9JLB9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nectin3Q9JLB9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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