Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chrac1Q9JKP8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms