Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trim39Q9ESN2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trim39Q9ESN2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trim39Q9ESN2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim39Q9ESN2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms