Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Subh2bvQ9D9Z7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Subh2bvQ9D9Z7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Subh2bvQ9D9Z7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Subh2bvQ9D9Z7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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