Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Capn9Q9D805 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Capn9Q9D805 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Capn9Q9D805 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Capn9Q9D805 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Capn9Q9D805 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Capn9Q9D805 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Capn9Q9D805 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Capn9Q9D805 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Capn9Q9D805 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Capn9Q9D805 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn9Q9D805 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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