Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rep15Q9D7T1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rep15Q9D7T1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rep15Q9D7T1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rep15Q9D7T1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rep15Q9D7T1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rep15Q9D7T1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rep15Q9D7T1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rep15Q9D7T1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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