Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Echdc3Q9D7J9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Echdc3Q9D7J9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms