Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q9D727 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q9D727 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9D727 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms