Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RpainQ9CWY9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RpainQ9CWY9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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RpainQ9CWY9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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