Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnot11Q9CWN7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnot11Q9CWN7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnot11Q9CWN7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cnot11Q9CWN7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Cnot11Q9CWN7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Cnot11Q9CWN7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Cnot11Q9CWN7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Cnot11Q9CWN7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Cnot11Q9CWN7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnot11Q9CWN7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot11Q9CWN7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnot11Q9CWN7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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