Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NubplQ9CWD8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms