Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rpa3Q9CQ71 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rpa3Q9CQ71 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpa3Q9CQ71 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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