Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Use1Q9CQ56 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Use1Q9CQ56 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Use1Q9CQ56 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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