Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mrpl27Q99N92 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mrpl27Q99N92 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms