Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ms4a4dQ99N05 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ms4a4dQ99N05 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ms4a4dQ99N05 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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