Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Q99M08 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q99M08 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q99M08 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms