Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Def8Q99J78 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms