Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SptssbQ925E8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms