Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smc1bQ920F6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smc1bQ920F6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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