Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd3Q91W18 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms