Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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