Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM4

Psmd2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd2Q8VDM4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd2Q8VDM4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms