Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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