Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek9Q8K1R7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms