Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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