Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms