Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup88Q8CEC0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms