Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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