Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lancl3Q8CD19 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lancl3Q8CD19 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms