Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms