Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm16223Q8CBM3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm16223Q8CBM3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm16223Q8CBM3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm16223Q8CBM3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm16223Q8CBM3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm16223Q8CBM3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm16223Q8CBM3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm16223Q8CBM3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm16223Q8CBM3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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