Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4aQ8C9S8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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