Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClmnQ8C5W0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClmnQ8C5W0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms