Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX10

Pgam5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgam5Q8BX10 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Pgam5Q8BX10 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Pgam5Q8BX10 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Pgam5Q8BX10 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Pgam5Q8BX10 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Pgam5Q8BX10 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Pgam5Q8BX10 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Pgam5Q8BX10 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Pgam5Q8BX10 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Pgam5Q8BX10 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgam5Q8BX10 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pgam5Q8BX10 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pgam5Q8BX10 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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